Родился 12 февраля  в Выксе. Окончил школу  № 3 г. Выксы в 1973 году и поступил  в Военно-медицинскую академию в г. Ленинграде. В 1979 году окончил академию с золотой медалью и получил направление в институт авиационно-космической медицины. Занимался вопросами медицинского обеспечения космических полётов, разработкой методов диагностики и коррекции состояния человека в экстремальных условиях жизнедеятельности. В 1990 г. защитил кандидатскую, а в 2002 г. – докторскую диссертацию по теме -  «Медико-биологическая реабилитация участников боевых действий». Ю. А. Бубеев – российский врач-психотерапевт, психофизиолог высшей категории, Заслуженный врач РФ, профессор, руководитель отдела психологии и психофизиологии Государственного научного центра — Института медико-биологических проблем РАН, член учёного и диссертационного советов ГНЦ РФ — ИМБП РАН, главный психолог проекта «Марс-500». Автор более 150 научных работ и 4 изобретений, специалист в области методов исследования резервных возможностей человека, антропомаксимологии, психотерапии боевых стрессовых расстройств. Под руководством Ю.А. Бубеева защищено 15 кандидатских диссертаций. На счету Ю.А. Бубеева пять командировок в Чечню, цель которых – оказание медико-психологической помощи участникам боевых действий непосредственно в зоне военных действий.  Ю.А. Бубеев – мастер спорта по альпинизму – совершал восхождения на вершины Памира, Эльбруса, Тянь-Шаня, Гиндукуша.